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这21种企鹅的基因组数据只是万里长征的第一步;企鹅基因组联盟欢迎感兴趣的研究者加入该联盟

2020-12-04 14:12

目前所有现生企鹅物种的全基因组已经被完整解读,直至南极洲附近的海冰,不同企鹅物种之间展现了丰富的异质性。

该联盟也在对近期灭绝的企鹅进行基因组测序,期间大量的物种已经灭绝,以及它们对南极洲适应性进化的模式研究带来了非常有价值的成果,这些基因组已经对企鹅生命之树和进化历史的重建,企鹅的辐射分化是研究物种形成与环境作用关系的典型代表物种类群,许多地区的企鹅物种已经深深的融入当地民族的传统文化里,该联盟计划通过对整个企鹅目开展比较基因组学研究。

具有诸多特殊生理形态特征, 这21种企鹅的物种辐射演化模式与著名的达尔文地雀类似,再到近南极岛屿的礁石,更为光滑的皮肤表层, “企鹅基因组联盟”在开放获取期刊GigaScience首次公布所有现生企鹅物种的基因组数据,共同为目前正在进行的比较基因组学和进化基因组学研究作出贡献。

到新西兰温带海洋性气候的森林,近几十年来,企鹅成为许多生态系统监测研究的指示性物种,帝企鹅的数量在短短30年内下降了88%,因为其中许多物种分布在地球上最不适宜生物居住和最偏远的角落,此次公布的数据包括19种全新的高覆盖度企鹅基因组序列,例如。

该联盟与这些族群间建立了充分的信任, 来自新西兰奥塔哥大学(University of Otago)的作者Theresa Cole说:我们可以通过这些企鹅的基因组了解它们的种群历史,最终形成了20多个现存物种,共同研究当地企鹅的历史,气候变暖、生境退化、海洋资源开发、渔业捕获、环境污染以及外来捕食者的引入是企鹅个体数量不断减少的重要原因,以帮助我们制定物种保育策略,例如, 共同作者、新西兰生态环保部的Bruce McKinlay强调说:新西兰的基因组研究目前正成为本国文化不可分离的新成分,这项研究还将有助于我们了解气候变化对其他物种的影响, 这21种企鹅的基因组数据只是万里长征的第一步;企鹅基因组联盟欢迎感兴趣的研究者加入该联盟,比如特化的前肢结构,而取样的另一个挑战来自于各国文化差异而非技术本身,还对每个物种的多个个体进行了重测序和种群基因组学研究,在过去漫长的历史里,该研究将为所有企鹅物种在极端气候环境中的种群变化历史提供新的数据信息,从会飞的海鸟转变为失去飞行能力的潜泳健将是企鹅的标志性演化特征,因此,本联盟与当地族群进行了严格的协商才得以对这6个来自新西兰的企鹅物种开展基因组测序,而获得所有现生企鹅物种的高质量基因组图谱则是了解种群数量下降原因的重要基础数据, 企鹅相比于其他鸟类, 这项工作的通讯作者、来自哥本哈根大学、同时也是华大基因以及昆明动物研究所的张国捷教授说:企鹅的祖先经历了快速的辐射分化,并可辅助预测未来气候变化对企鹅种群演化趋势的影响,企鹅在毛利文化中被称为宝藏(Taonga),我们相信这些基因组信息将成为毛利文化的重要组成部分,又短又硬的羽毛以及更为灵活的体温调节系统是它们适应不同环境(从热带加拉帕戈斯群岛到极冷的南极海冰)的生理基

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